电子版档案信息安全，作为档案管理信息系统研发的重要工作部分，保护档案信息安全还能体现出高科技集成性和系统研发人员技术水平。由于电子档案信息管理的原理与纸质文件截然不同，必须采取多种技术手段和措施对信息加以保护。

加密技术：

通综合档案管理系统为了防止档案被他人截获或修改，以实现信息的保密，专门设置对应的加密技术。

认证技术：

通综合档案管理系统认证技术主要有数字签名技术、身份识别技术和信息完整性校验技术等。

防病毒技术：

通综合档案管理系统通过制定严格的防病毒机制，使用各种软硬件杀毒技术等。

网络安全技术：

通综合档案管理系统网络安全技术，主要有防火墙技术、漏洞扫描技术、入侵检测技术等。防火墙技术主要有数据包过滤、代理服务器、监测型防火墙等。漏洞扫描技术通常采用被动式策略和主动式策略进行检测。入侵检测技术是对计算机和网络资源的恶意使用行为进行识别和响应处理的方法。

信息长期可存取性：

通综合档案管理系统主要采用软件仿真、数据迁移、载体转换等技术手段。

通综合档案管理系统资深产品经理指出：档案信息安全保护技术既相对独立，又相互补充，均为当今信息技术的前沿和核心技术，它们是动态的，是随着信息技术和材料技术的进步而进步的。档案信息安全不仅与载体的物化性质有关，更与元数据安全、计算机安全、网络安全和计算机软硬件技术的生命周期等方面有关，因此数字信息时代档案安全保护技术由单纯性的载体保护转变为系统性的高科技集成保护。